MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) chromosome

Total Repeats: 21401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004061	A	6	6	18	23	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
2	NC_004061	TGTTAT	2	12	30	41	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21672295
3	NC_004061	TGG	2	6	42	47	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672295
4	NC_004061	GCA	2	6	70	75	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672295
5	NC_004061	ATT	3	9	102	110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
6	NC_004061	A	6	6	116	121	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
7	NC_004061	TAT	2	6	137	142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
8	NC_004061	GGA	2	6	160	165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672295
9	NC_004061	GGT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672295
10	NC_004061	ATT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
11	NC_004061	CTG	2	6	275	280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672295
12	NC_004061	A	7	7	330	336	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
13	NC_004061	TTA	2	6	337	342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
14	NC_004061	A	7	7	342	348	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
15	NC_004061	A	6	6	396	401	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
16	NC_004061	TAT	2	6	461	466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
17	NC_004061	CTG	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672295
18	NC_004061	GAA	2	6	524	529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672295
19	NC_004061	ACC	2	6	609	614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672295
20	NC_004061	AATT	2	8	633	640	50 %	50 %	0 %	0 %	21672295
21	NC_004061	ATTT	2	8	647	654	25 %	75 %	0 %	0 %	21672295
22	NC_004061	T	6	6	683	688	0 %	100 %	0 %	0 %	21672295
23	NC_004061	ATC	2	6	710	715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672295
24	NC_004061	AC	4	8	739	746	50 %	0 %	0 %	50 %	21672295
25	NC_004061	A	6	6	752	757	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
26	NC_004061	ATA	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672295
27	NC_004061	TA	3	6	797	802	50 %	50 %	0 %	0 %	21672295
28	NC_004061	TAT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
29	NC_004061	T	7	7	890	896	0 %	100 %	0 %	0 %	21672295
30	NC_004061	AT	3	6	925	930	50 %	50 %	0 %	0 %	21672295
31	NC_004061	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
32	NC_004061	T	7	7	1044	1050	0 %	100 %	0 %	0 %	21672295
33	NC_004061	AG	3	6	1077	1082	50 %	0 %	50 %	0 %	21672295
34	NC_004061	T	7	7	1100	1106	0 %	100 %	0 %	0 %	21672295
35	NC_004061	TAC	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672295
36	NC_004061	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672295
37	NC_004061	TGA	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672295
38	NC_004061	ACT	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672295
39	NC_004061	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672295
40	NC_004061	TAG	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672295
41	NC_004061	A	7	7	1433	1439	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
42	NC_004061	A	8	8	1446	1453	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
43	NC_004061	AT	3	6	1459	1464	50 %	50 %	0 %	0 %	21672295
44	NC_004061	TTA	2	6	1540	1545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
45	NC_004061	A	6	6	1584	1589	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
46	NC_004061	AGC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672295
47	NC_004061	GAA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672295
48	NC_004061	A	6	6	1695	1700	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
49	NC_004061	TTA	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
50	NC_004061	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672295
51	NC_004061	CTA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672295
52	NC_004061	TTA	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
53	NC_004061	A	7	7	1863	1869	100 %	0 %	0 %	0 %	21672295
54	NC_004061	ATA	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672295
55	NC_004061	T	7	7	1907	1913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004061	TAA	2	6	1927	1932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004061	TTA	2	6	1945	1950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004061	TTATT	2	10	1973	1982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004061	TATT	2	8	1994	2001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004061	A	7	7	2017	2023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004061	AT	3	6	2058	2063	50 %	50 %	0 %	0 %	21672296
62	NC_004061	TCA	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672296
63	NC_004061	TTG	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672296
64	NC_004061	T	9	9	2190	2198	0 %	100 %	0 %	0 %	21672296
65	NC_004061	A	8	8	2220	2227	100 %	0 %	0 %	0 %	21672296
66	NC_004061	AATT	2	8	2267	2274	50 %	50 %	0 %	0 %	21672296
67	NC_004061	GTAT	2	8	2303	2310	25 %	50 %	25 %	0 %	21672296
68	NC_004061	A	6	6	2316	2321	100 %	0 %	0 %	0 %	21672296
69	NC_004061	T	7	7	2363	2369	0 %	100 %	0 %	0 %	21672296
70	NC_004061	T	7	7	2400	2406	0 %	100 %	0 %	0 %	21672296
71	NC_004061	ATTT	2	8	2409	2416	25 %	75 %	0 %	0 %	21672296
72	NC_004061	T	6	6	2425	2430	0 %	100 %	0 %	0 %	21672296
73	NC_004061	ATATTA	2	12	2465	2476	50 %	50 %	0 %	0 %	21672296
74	NC_004061	ATTTTA	2	12	2503	2514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672296
75	NC_004061	ACTT	2	8	2559	2566	25 %	50 %	0 %	25 %	21672296
76	NC_004061	ATC	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672296
77	NC_004061	T	6	6	2590	2595	0 %	100 %	0 %	0 %	21672296
78	NC_004061	T	6	6	2604	2609	0 %	100 %	0 %	0 %	21672296
79	NC_004061	TAT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672296
80	NC_004061	TTTTA	2	10	2691	2700	20 %	80 %	0 %	0 %	21672296
81	NC_004061	TGG	2	6	2719	2724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672296
82	NC_004061	T	8	8	2731	2738	0 %	100 %	0 %	0 %	21672296
83	NC_004061	TAA	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672296
84	NC_004061	TTTTAT	2	12	2787	2798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672296
85	NC_004061	TGT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672297
86	NC_004061	TAT	2	6	2928	2933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672297
87	NC_004061	ATTGGT	2	12	2962	2973	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21672297
88	NC_004061	GTA	2	6	2981	2986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672297
89	NC_004061	TTA	2	6	3028	3033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672297
90	NC_004061	T	6	6	3043	3048	0 %	100 %	0 %	0 %	21672297
91	NC_004061	TAG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672297
92	NC_004061	TA	3	6	3101	3106	50 %	50 %	0 %	0 %	21672297
93	NC_004061	ATTTT	2	10	3128	3137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004061	T	7	7	3134	3140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004061	A	7	7	3143	3149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004061	TTA	2	6	3150	3155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004061	T	6	6	3183	3188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004061	TTTTA	2	10	3208	3217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004061	CAA	2	6	3250	3255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672298
100	NC_004061	ATTT	2	8	3275	3282	25 %	75 %	0 %	0 %	21672298
101	NC_004061	TTTG	2	8	3285	3292	0 %	75 %	25 %	0 %	21672298
102	NC_004061	AT	4	8	3305	3312	50 %	50 %	0 %	0 %	21672298
103	NC_004061	CCT	2	6	3315	3320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672298
104	NC_004061	ATT	2	6	3321	3326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
105	NC_004061	GACAA	2	10	3338	3347	60 %	0 %	20 %	20 %	21672298
106	NC_004061	A	7	7	3346	3352	100 %	0 %	0 %	0 %	21672298
107	NC_004061	A	6	6	3378	3383	100 %	0 %	0 %	0 %	21672298
108	NC_004061	GAA	3	9	3387	3395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672298
109	NC_004061	TTA	3	9	3397	3405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
110	NC_004061	A	9	9	3409	3417	100 %	0 %	0 %	0 %	21672298
111	NC_004061	AAT	2	6	3425	3430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672298
112	NC_004061	TAT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
113	NC_004061	A	9	9	3477	3485	100 %	0 %	0 %	0 %	21672298
114	NC_004061	ATT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
115	NC_004061	A	7	7	3531	3537	100 %	0 %	0 %	0 %	21672298
116	NC_004061	T	7	7	3538	3544	0 %	100 %	0 %	0 %	21672298
117	NC_004061	A	6	6	3634	3639	100 %	0 %	0 %	0 %	21672298
118	NC_004061	TTA	2	6	3640	3645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
119	NC_004061	A	7	7	3683	3689	100 %	0 %	0 %	0 %	21672298
120	NC_004061	ATCA	2	8	3804	3811	50 %	25 %	0 %	25 %	21672299
121	NC_004061	A	7	7	3824	3830	100 %	0 %	0 %	0 %	21672299
122	NC_004061	TTA	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672299
123	NC_004061	A	8	8	3862	3869	100 %	0 %	0 %	0 %	21672299
124	NC_004061	TTAT	2	8	3904	3911	25 %	75 %	0 %	0 %	21672299
125	NC_004061	T	7	7	3916	3922	0 %	100 %	0 %	0 %	21672299
126	NC_004061	TTG	2	6	3927	3932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672299
127	NC_004061	TAA	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672299
128	NC_004061	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672299
129	NC_004061	TAA	2	6	4006	4011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672299
130	NC_004061	TAT	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672299
131	NC_004061	ATT	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672299
132	NC_004061	A	6	6	4128	4133	100 %	0 %	0 %	0 %	21672299
133	NC_004061	TA	4	8	4156	4163	50 %	50 %	0 %	0 %	21672299
134	NC_004061	ATC	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672299
135	NC_004061	A	7	7	4198	4204	100 %	0 %	0 %	0 %	21672299
136	NC_004061	AAAG	2	8	4323	4330	75 %	0 %	25 %	0 %	21672300
137	NC_004061	AATC	2	8	4353	4360	50 %	25 %	0 %	25 %	21672300
138	NC_004061	TAT	2	6	4376	4381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
139	NC_004061	ATG	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672300
140	NC_004061	ATGTT	2	10	4423	4432	20 %	60 %	20 %	0 %	21672300
141	NC_004061	TTA	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
142	NC_004061	AGGA	2	8	4598	4605	50 %	0 %	50 %	0 %	21672300
143	NC_004061	ATTT	2	8	4659	4666	25 %	75 %	0 %	0 %	21672300
144	NC_004061	AATT	2	8	4780	4787	50 %	50 %	0 %	0 %	21672300
145	NC_004061	TAT	2	6	4832	4837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
146	NC_004061	A	9	9	4843	4851	100 %	0 %	0 %	0 %	21672300
147	NC_004061	TAT	2	6	4898	4903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
148	NC_004061	A	7	7	4913	4919	100 %	0 %	0 %	0 %	21672300
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152	NC_004061	CTTCAG	2	12	4963	4974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21672300
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176	NC_004061	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672300
177	NC_004061	TTATTT	2	12	5839	5850	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_004061	A	7	7	5862	5868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_004061	A	6	6	5895	5900	100 %	0 %	0 %	0 %	21672301
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251	NC_004061	AT	3	6	8197	8202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_004061	TTG	2	6	8322	8327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672303
253	NC_004061	AT	5	10	8349	8358	50 %	50 %	0 %	0 %	21672303
254	NC_004061	ATAAAA	2	12	8362	8373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672303
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257	NC_004061	GTT	2	6	8424	8429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672303
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261	NC_004061	A	6	6	8538	8543	100 %	0 %	0 %	0 %	21672303
262	NC_004061	T	6	6	8639	8644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_004061	ATT	2	6	8657	8662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_004061	A	10	10	8681	8690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_004061	T	6	6	8708	8713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_004061	TA	3	6	8718	8723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_004061	T	7	7	8757	8763	0 %	100 %	0 %	0 %	21672304
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271	NC_004061	TTA	2	6	8817	8822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672304
272	NC_004061	TTG	2	6	8878	8883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672304
273	NC_004061	A	7	7	8936	8942	100 %	0 %	0 %	0 %	21672304
274	NC_004061	TTA	2	6	8959	8964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672304
275	NC_004061	T	6	6	8979	8984	0 %	100 %	0 %	0 %	21672304
276	NC_004061	ATTT	2	8	8990	8997	25 %	75 %	0 %	0 %	21672304
277	NC_004061	T	6	6	9004	9009	0 %	100 %	0 %	0 %	21672304
278	NC_004061	ATTTTC	2	12	9026	9037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21672304
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281	NC_004061	A	6	6	9096	9101	100 %	0 %	0 %	0 %	21672304
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